尼康显微镜配件分为：目镜、目镜观察筒、物镜、聚光镜、机械载物台、调焦系统、物镜转盘、LED光源、相机端口、摄像头、滑块及各种附件等。其中目镜与物镜的安装非常重要：

1、尼康显微镜目镜的安装
目镜的安装过程并不复杂，只是在操作中需注意不要划伤或磨损镜片。先取下目镜筒上的防尘盖，然后把选择的目镜从目镜筒上端插入。如果要更换不同的目镜，那么依照上面的操作，更换目镜筒中目镜即可。安装好目镜后要注意检查目镜和目镜筒支承面的重合度。

2、尼康显微镜物镜的安装
多数的显微镜，物镜安装都是在物镜转换器上。安装过程中同样要注意轻拿轻放，以免划伤和磨损物镜。
首先转动粗动手轮，升高载物台。这里要在载物台升高时观察它和物镜转换器之间的距离，保持间距足够大。
然后把物镜按照一定次序旋入物镜转换器的螺孔中。一般情况下物镜顺序按低倍、中倍、高倍顺序，不可随意调换次序。此时需注意，不要松手以免物镜跌落。
旋转螺纹，上紧物镜，注意保持物镜的松紧适中。
最后转动转换器，把物镜转到合适位置，直到听到轻微的“咔嚓”声，这表示转换器已固定吻合，可以工作了。
尼康显微镜目镜和物镜的安装过程基本就这样。因为尼康显微镜是精密光学仪器，所以全程都要小心谨慎，不要磨损镜片。在操作时也要注意细节，例如不可扳着物镜推动转换器，以免顺坏螺纹。只有按照规定规程操作，才能有效的保护好显微镜。